1979 – 1999
28 września 1979
Przemianowanie PWSM w Akademię Muzyczną.
1984
Początek współpracy z Stendal Foundation (Szwajcaria) – nawiązanie współpracy z Międzynarodową Letnią Szkołą w Burgthann/Nürnberg.
1985
Organizacja Ogólnopolskiego Konkursu Klawesynowego im. Wandy Landowskiej.
1986
Początek współpracy z Międzynarodową Akademią Bachowską ze Stuttgartu, kierowaną przez prof. dr h.c. Helmuth Rillinga (J.S. Bach Pasja wg św. Mateusza)
1987 – 1993
Rektor – prof. Krystyna Moszumańska-Nazar, wybitny kompozytor
1988
100-lecie Akademii Muzycznej w Krakowie.
1990
II Międzynarodowa Akademia Bachowska – współpraca i udział w corocznych koncertach wyróżniających się studentów Akademii Muzycznych w Polsce (J.S. Bach Weihnachtsoratorium).
1991
- Powstanie Katedry Interpretacji Muzyki Współczesnej.
- Zainicjowanie cyklu dorocznych spotkań „Kurs Wykonawstwa Muzyki Dawnej” prowadzonych przez holenderskich specjalistów muzyki XVII i XVIII wieku z Konserwatorium w Amsterdamie.
1992
- III Międzynarodowa Akademia Bachowska w ramach Europejskiego Miesiąca Kultury w Krakowie (J.S. Bach Msza h-moll).
- Organizacja międzykatedralnego konkursu „Tria i Kwartety Fortepianowe W.A. Mozarta” z okazji 200-tnej rocznicy śmierci kompozytora.
1993
- IV Międzynarodowa Akademia Bachowska (J.S. Bach Pasja wg św. Jana).
- Otrzymanie przez Akademię na własność od władz wojewódzkich i miejskich budynków przy ul. św. Tomasza 43.
1993 – 1999
Rektor – prof. Marek Stachowski, wybitny kompozytor
1994
Pierwszy w historii Akademii doktorat honoris causa nadany prof. Krzysztofowi Pendereckiemu.
1995
- V Międzynarodowa Akademia Bachowska (A. Dvořak Stabat Mater).
- Ustanowienie nagrody EXCELLENCE IN TEACHING – „Za doskonałe wyniki w pracy dydaktycznej” – przez małżeństwo Prof. Ray E. i Ruth A. Robinson z USA.
1997
- Nadanie tytułu doktora honoris causa Paulowi Sacherowi.
- Współpraca z Elżbietą i Krzysztofem Pendereckimi w stworzeniu koncepcji i realizacji Wielkanocnego Festiwalu Ludwiga van Beethovena w Krakowie. (Rada programowa: prof. dr hab. M. Tomaszewski, dr (II st.) T. Malecka).
- Organizacja I Międzynarodowego Sympozjum Beethovenowskiego – w ramach I Wielkanocnego Festiwalu Ludwiga van Beethovena. Kierownictwo naukowe: prof. dr hab. M.Tomaszewski.
1998
- VI Międzynarodowa Akademia Bachowska (K. Penderecki Credo).
- Wejście do Europejskiego programu Sokrates/Erasmus – podpisanie pierwszych umów bilateralnych z uczelniami zachodnimi.
- Współpraca programowa w organizacji II Wielkanocnego Festiwalu Ludwiga van Beethovena „Beethoven i poprzednicy”.
- Współpraca z Elżbietą Penderecką w opracowaniu koncepcji i organizacji Festiwalu Krzysztofa Pendereckiego (Rada Programowa prof. dr hab. M. Tomaszewski, dr (II st.) T. Malecka).
- Organizacja Międzynarodowego Sympozjum „Muzyka Krzysztofa Penderckiego w kontekście teatru XX wieku”.
- Europejskie prawykonanie Credo Krzysztofa Pendereckiego podczas Festiwalu Krzysztofa Pendereckiego w Krakowie w dniu 5 października 1998 roku, przygotowane przez zespoły Orkiestry i Chóru Międzynarodowej Akademii Bachowskiej oraz Akademii Muzycznej w Krakowie pod dyr. prof. dr h. c. Helmutha Rillinga.
- Przeniesienie Biblioteki Głównej Akademii Muzycznej w Krakowie z ul. Starowiślnej na ul. św. Tomasza 43.
1999
- I Międzynarodowy Konkurs Fletowy (dyrektor artystyczny prof. Barbara Świątek–Żelazna).
- I Letnia Akademia Muzyczna (dyrektor artystyczny prof. Andrzej Pikul).
- III Wielkanocny Festiwal Ludwiga van Beethovena „Beethoven i romantycy”.